按照《管理办法》，由城市管理部门或者本级人民政府（管委会）授权的管理单位作为项目业主单位，通过招投标等公平竞争方式确定服务企业的城市生活垃圾经营性清扫、收集、运输、处置服务项目，应当申请办理行政许可。因此，负责某小区清扫保洁及垃圾运输的物业公司，不需要办理行政许可。